마이크로바이옴이란 인체에 서식하는 "미생물(microbe)"과 "생태계(biome)"를 합친 말로 우리 몸에 사는 미생물과 그 유전정보를 일컫는다.

인체 마이크로바이옴의 수는 순수한 인체의 세포수 보다 두 배 이상 많고 유전자의 수는 100배 이상 많다. 따라서 미생물을 빼놓고 인간의 유전자를 논할 수 없을 정도이기에 제2의 게놈(Second Genome)이라 부르기도 한다.
마이크로바이옴은 유익균과 유해균이 생성되는 원리와 질병간의 연관성 등을 분석할 수 있어 신약 개발 및 불치병 치료법 연구에 폭넓게 활용될 수 있는 분야다. 또한 마이크로바이옴은 식품, 화장품, 치료제 개발에 쓰인다. 다만 이를 활용한 의약품 개발 연구는 대부분 초기 단계여서 제품 개발까지는 시간이 걸릴 전망이다.
출처 : [네이버 지식백과] 마이크로바이옴 [Microbiome] (한경 경제용어사전)
 
마이크로바이옴(Microbiome)은 특정 환경에 존재하고 있는 미생물들과 이들의 유전정보 전체를 말하는 것으로, 단일 생명체의 유전정보 전체를 뜻하는 게놈(Genome)들의 집합체를 뜻한다. 따라서 인체 마이크로바이옴(Human Microbiome)은 인간 몸체 안팎에 서식하고 있는 미생물들과 그들의 유전정보 전체를 말한다.
인간은 출생부터 죽음에 이르기까지 미생물과는 뗄 수 없는 관계로 인체 곳곳에 존재하는 미생물의 수는 인간 세포의 2배 이상, 그리고 미생물들의 유전자 총합은 인간 유전자 개수의 100배 이상으로 알려져 있다. 인체 마이크로바이옴은 신체 다양한 부위에 따라서 해당 부위에 서식하는 미생물들의 종류가 달라지고, 그에 따라 서로 다른 특성을 가지게 된다.
 
이러한 인체 마이크로바이옴은 그 구성에 따라 인간 건강에 지대한 영향을 미치기도 한다.
인체에 서식하는 대부분의 미생물은 인간에게 어떤 해도 끼치지 않으면서 존재하는 공생균(Commensal microorganism)으로써 이들 중 일부는 인간 세포가 만들 수 없는 대사 물질을 생성하거나 병원균의 생장을 억제하는 등 인간에게 이로운 효과를 나타내는 유익균(Beneficial microorganism)이다. 하지만 특정 신체 부위에서는 일반 공생균으로서 존재하지 만 다른 신체 부위 혹은 컨디션 등 환경 조건에 따라서는 병원성을 나타내는 유해균(Pathobiont)도 존재한다.
인체 여러 부위 중에서 장(腸)내에는 가장 많은 숫자의 미생물들이 높은 다양성을 가지고 서식하고 있다. 그래서 경우에 따라서는 장내 마이크로바이옴(Intestinal microbiome)을 인체 마이크로바이옴이라고 하기도 하며, 그 수와 다양성이 매우 커서 인간의 세컨드 게놈(Second genome)이라고 하기도 한다. 이러한 장내 마이크로바이옴은 장 질환뿐만 아니라 아토피와 같은 피부 질환, 비만이나 당뇨병고 같은 대사 질환, 그리고 최근에는 우울증 등의 정신 질환과 노화 등 다양한 질병과 인간 건강에 큰 영향을 미친다고 보고되고 있다.
 
이러한 인체 마이크로바이옴에 대한 중요성은 수 십 년 전부터 알려져 왔으며, 그 중요성이 점점 커져 약 10년 전부터는 여러 나라가 국제 컨소시엄을 형성하여 대형 국제 프로젝트들을 형성하였고, 대규모 인력과 자금이 투입되어 인체 마이크로바이옴에 관해 연구를 수행하였다.